MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL7

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012002	TTTC	2	8	35	42	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012002	GGA	2	6	53	58	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012002	T	6	6	73	78	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012002	T	6	6	236	241	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
5	NC_012002	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143514
6	NC_012002	AAGT	2	8	274	281	50 %	25 %	25 %	0 %	222143514
7	NC_012002	TTC	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
8	NC_012002	T	6	6	392	397	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
9	NC_012002	CA	3	6	436	441	50 %	0 %	0 %	50 %	222143514
10	NC_012002	TCG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143514
11	NC_012002	T	6	6	489	494	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
12	NC_012002	TCA	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143514
13	NC_012002	T	6	6	634	639	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
14	NC_012002	ACA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143514
15	NC_012002	CCA	2	6	676	681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222143514
16	NC_012002	CTT	2	6	728	733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
17	NC_012002	TTC	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
18	NC_012002	AAT	2	6	765	770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143514
19	NC_012002	TTA	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143514
20	NC_012002	TCC	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143515
21	NC_012002	CTT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143515
22	NC_012002	TTG	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143515
23	NC_012002	GTT	2	6	1112	1117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143515
24	NC_012002	AAC	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143515
25	NC_012002	TCT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143515
26	NC_012002	CGAAA	2	10	1302	1311	60 %	0 %	20 %	20 %	222143515
27	NC_012002	T	6	6	1322	1327	0 %	100 %	0 %	0 %	222143515
28	NC_012002	T	8	8	1329	1336	0 %	100 %	0 %	0 %	222143515
29	NC_012002	CAGA	2	8	1364	1371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012002	TCTG	2	8	1391	1398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012002	T	6	6	1426	1431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012002	CCCT	2	8	1440	1447	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_012002	CAA	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012002	CAG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012002	C	6	6	1683	1688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_012002	CCT	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012002	A	6	6	1709	1714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012002	TTCTTG	2	12	1728	1739	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012002	A	7	7	1857	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012002	CA	3	6	1865	1870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012002	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143516
42	NC_012002	TCTT	2	8	2000	2007	0 %	75 %	0 %	25 %	222143516
43	NC_012002	GAC	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143516
44	NC_012002	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143516
45	NC_012002	TTC	3	9	2077	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143516
46	NC_012002	GA	3	6	2118	2123	50 %	0 %	50 %	0 %	222143516
47	NC_012002	AAG	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143516
48	NC_012002	TTTC	2	8	2195	2202	0 %	75 %	0 %	25 %	222143516
49	NC_012002	GCA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143516
50	NC_012002	TTC	2	6	2244	2249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143516
51	NC_012002	CTC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012002	T	6	6	2292	2297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012002	TGG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012002	ATC	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012002	TTTA	2	8	2375	2382	25 %	75 %	0 %	0 %	222143517
56	NC_012002	TCA	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143517
57	NC_012002	GTTT	2	8	2401	2408	0 %	75 %	25 %	0 %	222143517
58	NC_012002	TC	3	6	2444	2449	0 %	50 %	0 %	50 %	222143517
59	NC_012002	TCT	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
60	NC_012002	ATTTG	2	10	2628	2637	20 %	60 %	20 %	0 %	222143517
61	NC_012002	T	8	8	2639	2646	0 %	100 %	0 %	0 %	222143517
62	NC_012002	GAAG	2	8	2668	2675	50 %	0 %	50 %	0 %	222143517
63	NC_012002	TATC	2	8	2705	2712	25 %	50 %	0 %	25 %	222143517
64	NC_012002	GTA	2	6	2724	2729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143517
65	NC_012002	TTC	2	6	2850	2855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
66	NC_012002	TTA	2	6	2887	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143517
67	NC_012002	ACA	2	6	2923	2928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143517
68	NC_012002	TCC	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143517
69	NC_012002	TAAA	2	8	2975	2982	75 %	25 %	0 %	0 %	222143517
70	NC_012002	TC	3	6	3133	3138	0 %	50 %	0 %	50 %	222143517
71	NC_012002	AAT	2	6	3162	3167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143517
72	NC_012002	GAA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143517
73	NC_012002	A	6	6	3175	3180	100 %	0 %	0 %	0 %	222143517
74	NC_012002	TTC	2	6	3186	3191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
75	NC_012002	TTCA	2	8	3246	3253	25 %	50 %	0 %	25 %	222143517
76	NC_012002	T	6	6	3272	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012002	ATT	2	6	3299	3304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012002	TTA	2	6	3464	3469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012002	AT	3	6	3471	3476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012002	AT	5	10	3483	3492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012002	AGT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012002	GT	3	6	3631	3636	0 %	50 %	50 %	0 %	222143518
83	NC_012002	CTG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143518
84	NC_012002	TCT	2	6	3661	3666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143518
85	NC_012002	TTTC	2	8	3710	3717	0 %	75 %	0 %	25 %	222143518
86	NC_012002	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143518
87	NC_012002	GAG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222143518
88	NC_012002	ATA	2	6	3756	3761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143518
89	NC_012002	GATA	2	8	3829	3836	50 %	25 %	25 %	0 %	222143518
90	NC_012002	CAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143518
91	NC_012002	CT	3	6	3897	3902	0 %	50 %	0 %	50 %	222143518
92	NC_012002	T	6	6	3915	3920	0 %	100 %	0 %	0 %	222143518
93	NC_012002	CTTTT	2	10	3936	3945	0 %	80 %	0 %	20 %	222143518
94	NC_012002	TTCT	2	8	3950	3957	0 %	75 %	0 %	25 %	222143518
95	NC_012002	TTC	2	6	3960	3965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143518
96	NC_012002	GTC	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012002	TCTTTT	2	12	4039	4050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.